Skip to main content

Table 4 List of proteins identified from bands showing changes after Holder pasteurization

From: Effects of Holder pasteurization on the protein profile of human milk

Band no. Protein ID AC number (gi NCBI) Theoretical Mr (kDa) MASCOT score Sequence coverage (%) MS/MS sequencing
1 TNC variant protein 68533131 244.2 1177 15 % R.LEELENLVSSLR.E
       K.FTTDLDSPR.D
       R.ELEPGVEYFIR.V
       R.VFAILENKK.S
       R.VATYLPAPEGLK.F
       R.QTGLAPGQEYEISLHIVK.N
       R.LDAPSQIEVK.D
       K.ETFTTGLDAPR.N
       R.VSQTDNSITLEWR.N
       K.TTLTGLRPGTEYGIGVSAVK.E
       K.EDKESNPATINAATELDTPK.D
       K.ESNPATINAATELDTPK.D
       R.GLEPGQEYNVLLTAEK.G
       K.AATPYTVSIYGVIQGYR.T
       R.AVDIPGLEAATPYR.V
       R.TPVLSAEASTAK.E
       K.QSEPLEITLLAPER.T
       R.EATEYEIELYGISK.G
       R.APTAQVESFR.I
       K.FTTDLDSPR.D
       R.DLTATEVQSETALLTWRPPR.A
       K.EVIVGPDTTSYSLADLSPSTHYTAK.I
       K.IQALNGPLR.S
       R.EEFWLGLDNLNK.I
       K.ITAQGQYELR.V
       R.DHGETAFAVYDKFSVGDAK.T
2 Beta-casein 288098 25.2 63 12 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
3 Beta-casein 288098 25.2 65 12 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
4 Lactotransferrin 16198359 78.3 333 8 % R.YYGYTGAFR.C
       R.THYYAVAVVK.K
       R.SDTSLTWNSVK.G
       R.CLAENAGDVAFVK.D
       R.RSDTSLTWNSVK.G
       K.LRPVAAEVYGTER.Q
  Immunoglobulin kappa light chain VLJ region 21669409 29.8 118 17 % R.TVAAPSVFIFPPSDEQLK.S
       K.DSTYSLSSTLTLSK.A
       K.VYACEVTHQGLSSPVTK.S
  Beta-casein 288098 25.2 106 28 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
       R.AVPVQALLLNQELLLNPTHQIYPVTQPLAPVHNPISV.-
  Immunoglobulin lambda light chain 33700 25.2 77 20 % R.SYSCQVTHEGSTVEK.T
       K.YAASSYLSLTPEQWK.S
       K.AAPSVTLFPPSSEELQANK.A
5 Immunoglobulin kappa light chain VLJ region 21669357 29.5 381 34 % K.LLIYWASTR.E
       K.DSTYSLSSTLTLSK.A
       K.SGTASVVCLLNNFYPR.E
       K.LYACEVTHQGLSSPVTK.S
       R.TVAAPSVFIFPPSDEQLK.S
       K.VDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSK.A
  Alpha S1-casein 1359714 20.7 192 19 % R.LQNPSESSEPIPLESR.E
       R.LNEYNQLQLQAAHAQEQIR.R
  Immunoglobulin lambda light chain 33700 25.2 139 14 % K.YAASSYLSLTPEQWK.S
       K.AAPSVTLFPPSSEELQANK.A
  Beta-casein precursor 4503087 25.4 115 11 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
6 Beta-casein 288098 25.2 49 12 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
7 Alpha S1-casein 1359714 20.7 56 10 % R.LNEYNQLQLQAAHAQEQIR.R
  Beta-casein 288098 25.2 50 12 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
8 Beta-casein 288098 25.2 38 12 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
9 Beta-casein 288098 25.2 81 12 % K.SPTIPFFDPQIPK.L
       K.VLPIPQQVVPYPQR.A
  tenascin 37227 240.6 70 1 % R.LEELENLVSSLR.E
  alpha S1-casein 1359714 20.7 65 10 % R.LNEYNQLQLQAAHAQEQIR.R
10 Lactoferrin 186833 78.3 203 3 % R.THYYAVAVVK.K
       K.LADFALLCLDGK.R
       K.NLLFNDNTECLAR.L
  Beta-casein 288098 25.2 38 6 % K.VLPIPQQVVPYPQR.A